İsviçre'nin Nyon kentindeki UEFA Genel Merkezi'nde, genel sekreter Gianni Infantino ve organizasyon direktörü Giorgio Marchetti yönetiminde  düzenlenen kura çekiminde Fenerbahçe'nin rakibi, Yunanistan'ın Atromitos takımı  oldu.
 
Trabzonspor'u eleyen Makedonya temsilcisi Rabotnicki, Rusya'dan Rubin  Kazan, Medipol Başakşehir'i saf dışı bırakan Hollanda'nın AZ Alkmaar takımı ise  Romanya'dan Astra Giurgiu ile eşleşti.

Eleme usulü yapılacak play-off turunda ilk karşılaşmalar 20 Ağustos,  rövanşları ise 27 Ağustos'ta yapılacak. Eşleşmelerde birinci sırada yer alan  takımlar ilk maçını sahasında, ikincisini deplasmanda oynayacak. 
 
UEFA Avrupa Ligi play-off eleme turunda eşleşmeler şöyle: 
 
Altach (Avusturya) - Belenenses (Portekiz) 
Steaua Bükreş (Romanya) - Rosenborg (Norveç) 
Viktoria Plzen (Çek Cumhuriyeti) - Vojvodina (Sırbistan) 
Jablonec (Çek Cumhuriyeti) - Ajax (Hollanda) 
Molde (Norveç) - Standard Liege (Belçika) 
Zilina (Slovakya) - Athletic Bilbao (İspanya) 
Zorya (Ukrayna) - Legia Varşova (Polonya) 
Milsami (Moldova) - Saint-Etienne (Fransa) 
Young Boys (İsviçre) - Karabağ (Azerbaycan) 
PAOK (Yunanistan) - Brondby (Danimarka) 
Bordeaux (Fransa) - Kairat (Kazakistan) 
Dinamo Minsk (Belarus) - Salzburg (Avusturya) 
Slovan Liberec (Çek Cumhuriyeti) - Hajduk Split (Hırvatistan) 
Panathinaikos (Yunanistan) - Kabala (Azerbaycan) 
Astra Giurgiu (Romanya) - AZ Alkmaar (Hollanda) 
Krasnodar (Rusya) - HJK Helsinki (Finlandiya) 
Lech Poznan (Polonya) - Videoton (Macaristan) 
Rabotnicki (Makedonya) - Rubin Kazan (Rusya) 
Atromitos (Yunanistan) - Fenerbahçe (Türkiye) 
Southampton (İngiltere) - Midtjylland (Danimarka) 
Odds (Norveç) - Borussia Dortmund (Almanya) 
Thun (İsviçre) - Sparta Prag (Çek Cumhuriyeti)